בימים אלה הסתיימו פעולות שימור פנים בית הכנסת הגדול. השימור נעשה בשיתוף עיריית ראשון-לציון ואגף מורשת במשרד ראש הממשלה, שהכיר במוזאון ראשון לציון ובבית הכנסת כאתר מורשת לאומית.
במסגרת זו נחשפו, שומרו ושוחזרו ציורי הקיר שעדויות להם נמצאו כבר בסקר מקדים וכל פנים בית הכנסת שב למראהו המקורי מסוף המאה ה-19. רצפות העץ היפהפיות שנחשפו טופלו, בימת העץ שוחזרה כמו גם כל חלקי העץ ותקרות העץ המרשימות שלו.
אבן הפינה לבית הכנסת הגדול הונחה על ידי אנשי ראשון-לציון בשלהי שנת 1884. בשלב הראשון נבנו המרתף והקומה הראשונה. אולם בשל בעיות שהערים השלטון התורכי נפסקה הבניה והסתיימה בשנת 1889. ארון הקודש, הניצב בבית הכנסת עד היום וריהוט בית הכנסת, נבנו על ידי האחים האמנים מיפו, יצחק ומשה יהושע הימן.
עד להקמת בית העם בשנת 1898, היה בית הכנסת המוסד הציבורי היחיד במושבה. בנוסף לתפילות נערכו בו אסיפות עם וקבלות פנים לאישים חשובים. הברון רוטשילד נאם מעל בימת בית הכנסת בשנת 1899. מרתף בית הכנסת שימש בתחילה כבית הספר לבנים ובשנת 1898 נוסד בו גן הילדים העברי הראשון בעולם.
